Is e aillse pancreatic aon de na tumhan as marbhtach san t-saoghal le droch prognosis.Mar sin, tha feum air modal ro-innse neo-mhearachdach gus euslaintich a tha ann an cunnart àrd aillse pancreatic a chomharrachadh gus làimhseachadh a dhèanamh freagarrach agus adhartas nan euslaintich sin a leasachadh.
Fhuair sinn dàta RNAseq adenocarcinoma pancreatic Atlas Genome Atlas (TCGA) (PAAD) bho stòr-dàta UCSC Xena, chomharraich lncRNAn co-cheangailte ri dìonachd (irlncRNAs) tro sgrùdadh co-dhàimh, agus chomharraich sinn eadar-dhealachaidhean eadar TCGA agus stuthan adenocarcinoma pancreatic àbhaisteach.DEirlncRNA) bho TCGA agus abairt clò genotype (GTEx) de stuth pancreatic.Chaidh tuilleadh mion-sgrùdaidhean ath-thionndaidh univariate agus lasso a dhèanamh gus modalan ainm-sgrìobhte prognostic a thogail.An uairsin rinn sinn cunntas air an raon fon lùb agus cho-dhùin sinn an luach gearraidh as fheàrr airson a bhith a’ comharrachadh euslaintich le adenocarcinoma pancreatic le cunnart àrd agus ìosal.Gus coimeas a dhèanamh eadar feartan clionaigeach, in-shìoladh cheallan dìon, meanbh-àrainneachd dìonachd, agus strì an aghaidh chemotherapy ann an euslaintich le aillse pancreatic àrd agus le cunnart ìosal.
Chomharraich sinn 20 paidhir DEirlncRNA agus chuir sinn euslaintich ann am buidhnean a rèir an luach gearraidh as fheàrr.Sheall sinn gu bheil coileanadh mòr aig a’ mhodal ainm-sgrìobhte prognostic againn ann a bhith a’ ro-innse prognosis euslaintich le PAAD.Is e an AUC den lùb ROC 0.905 airson an ro-aithris 1-bliadhna, 0.942 airson an ro-aithris 2-bliadhna, agus 0.966 airson an ro-aithris 3-bliadhna.Bha ìrean mairsinn nas ìsle aig euslaintich le cunnart àrd agus feartan clionaigeach na bu mhiosa.Sheall sinn cuideachd gu bheil euslaintich le cunnart àrd air an dìon le dìonachd agus gum faodadh iad cur an aghaidh immunotherapy.Is dòcha gum bi measadh air drogaichean anticancer leithid paclitaxel, sorafenib, agus erlotinib stèidhichte air innealan ro-innse coimpiutaireachd iomchaidh airson euslaintich le cunnart àrd le PAAD.
Gu h-iomlan, stèidhich an sgrùdadh againn modal cunnart prognostic ùr stèidhichte air irlncRNA càraideach, a sheall luach prognostic gealltanach ann an euslaintich le aillse pancreatic.Dh’ fhaodadh ar modal cunnairt prognostic cuideachadh le bhith ag eadar-dhealachadh euslaintich le PAAD a tha freagarrach airson làimhseachadh meidigeach.
Is e tumhair malignant a th’ ann an aillse pancreatic le ìre mairsinn còig bliadhna ìosal agus ìre àrd.Aig àm breithneachadh, tha a ‘mhòr-chuid de dh’ euslaintich aig ìrean adhartach mar-thà.Ann an co-theacsa an tinneas tuiteamach COVID-19, tha dotairean agus banaltraman fo chuideam mòr nuair a bhios iad a’ làimhseachadh euslaintich le aillse pancreatic, agus tha teaghlaichean euslaintich cuideachd a’ cur aghaidh air iomadh cuideam nuair a bhios iad a’ dèanamh cho-dhùnaidhean làimhseachaidh [1, 2].Ged a chaidh adhartasan mòra a dhèanamh ann an làimhseachadh DOADn, leithid leigheas neoadjuvant, resection lannsa, leigheas rèididheachd, chemotherapy, leigheas moileciuil cuimsichte, agus luchd-dìon puing-seicidh (ICIs), chan eil ach mu 9% de dh'euslaintich beò còig bliadhna an dèidh breithneachadh. ].], 4].Leis gu bheil comharran tràth adenocarcinoma pancreatic neo-àbhaisteach, mar as trice bidh euslaintich air am breithneachadh le meata-mheadhain aig ìre adhartach [5].Mar sin, airson euslainteach sònraichte, feumaidh làimhseachadh coileanta fa leth cuideam a chuir air buannachdan agus eas-bhuannachdan gach roghainn làimhseachaidh, chan ann a-mhàin airson mairsinn beò, ach cuideachd gus càileachd beatha adhartachadh [6].Mar sin, tha feum air modal ro-innse èifeachdach gus measadh ceart a dhèanamh air prognosis euslainteach [7].Mar sin, faodar làimhseachadh iomchaidh a thaghadh gus mairsinn agus càileachd beatha euslaintich le PAAD a chothromachadh.
Tha an droch prognosis de PAAD gu ìre mhòr mar thoradh air strì an aghaidh dhrogaichean chemotherapy.Anns na bliadhnachan mu dheireadh, chaidh luchd-dìon puing-dìon a chleachdadh gu farsaing ann a bhith a 'làimhseachadh tumors cruaidh [8].Ach, is ann ainneamh a bhios cleachdadh ICIn ann an aillse pancreatic soirbheachail [9].Mar sin, tha e cudromach euslaintich a chomharrachadh a dh’ fhaodadh buannachd fhaighinn bho leigheas ICI.
Is e seòrsa de RNA neo-chòdachadh le tar-sgrìobhaidhean> 200 nucleotides a th’ ann an RNA fada neo-chòdachadh (lncRNA).Tha LncRNAn farsaing agus tha iad a’ dèanamh suas mu 80% den tar-sgrìobhadh daonna [10].Tha buidheann mòr obrach air sealltainn gum faod modalan prognostic stèidhichte air lncRNA ro-innse èifeachdach a dhèanamh air prognosis euslaintich [11, 12].Mar eisimpleir, chaidh lncRNAn co-cheangailte ri autophagy 18 a chomharrachadh gus ainmean prognostic a ghineadh ann an aillse broilleach [13].Chaidh sia lncRNAn eile co-cheangailte ri dìonachd a chleachdadh gus feartan prognostic glioma [14] a stèidheachadh.
Ann an aillse pancreatic, tha cuid de sgrùdaidhean air ainmean-sgrìobhte lncRNA a stèidheachadh gus ro-innse euslaintich a ro-innse.Chaidh ainm-sgrìobhte 3-lncRNA a stèidheachadh ann an adenocarcinoma pancreatic le raon fo lùb ROC (AUC) de dìreach 0.742 agus mairsinn iomlan (OS) de 3 bliadhna [15].A bharrachd air an sin, tha luachan abairt lncRNA ag atharrachadh am measg diofar genomes, diofar chruthan dàta, agus diofar euslaintich, agus tha coileanadh a’ mhodail ro-innse neo-sheasmhach.Mar sin, bidh sinn a’ cleachdadh algairim modaladh ùr-nodha, paidhir agus itealachadh, gus ainmean-sgrìobhte lncRNA (irlncRNA) co-cheangailte ri dìonachd a ghineadh gus modal ro-innse nas cruinne agus nas seasmhaiche a chruthachadh [8].
Chaidh dàta RNAseq àbhaisteach (FPKM) agus aillse pancreatic clionaigeach TCGA agus dàta abairt clò genotype (GTEx) fhaighinn bho stòr-dàta UCSC XENA ( https://xenabrowser.net/datapages/ ).Chaidh faidhlichean GTF fhaighinn bho stòr-dàta Ensembl ( http://asia.ensembl.org ) agus an cleachdadh gus pròifilean abairt lncRNA a thoirt a-mach à RNAseq.Luchdaich sìos sinn ginean co-cheangailte ri dìonachd bho stòr-dàta ImmPort (http://www.immport.org) agus chomharraich sinn lncRNAn co-cheangailte ri dìonachd (irlncRNAs) a’ cleachdadh mion-sgrùdadh co-dhàimh (p <0.001, r> 0.4).Comharrachadh irlncRNAs air an cur an cèill gu eadar-dhealaichte (DEirlncRNAs) le bhith a’ dol thairis air irlncRNAs agus lncRNAs air an cur an cèill gu eadar-dhealaichte a gheibhear bho stòr-dàta GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) anns a’ bhuidheann TCGA-PAAD (| logFC |> 1 agus FDR ) <0.05).
Chaidh aithris air an dòigh seo roimhe [8].Gu sònraichte, bidh sinn a’ togail X gus an lncRNA A agus lncRNA B a chur an àite nan càraidean lncRNA A agus lncRNA B. Nuair a tha luach abairt lncRNA A nas àirde na luach abairt lncRNA B, tha X air a mhìneachadh mar 1, air neo tha X air a mhìneachadh mar 0. Mar sin, gheibh sinn matrix de 0 no – 1. Tha axis dhìreach na matrix a’ riochdachadh gach sampall, agus tha an axis chòmhnard a’ riochdachadh gach paidhir DEirlncRNA le luach 0 neo 1.
Chaidh mion-sgrùdadh ath-tharraing aon-atharrachail agus ath-thilleadh Lasso a chleachdadh gus paidhrichean prognostic DEirlncRNA a sgrionadh.Chleachd an anailis ath-tharraing lasso tar-dhearbhadh 10-fhillte a-rithist 1000 uair (p <0.05), le 1000 brosnachaidh air thuaiream gach ruith.Nuair a chaidh tricead gach paidhir DEirlncRNA thairis air 100 uair ann an cearcallan 1000, chaidh paidhrichean DEirlncRNA a thaghadh gus modal cunnart prognostic a thogail.Chleachd sinn an uairsin an lùb AUC gus an luach gearraidh as fheàrr a lorg airson a bhith a’ seòrsachadh euslaintich PAAD ann am buidhnean le cunnart àrd is ìosal.Chaidh luach AUC gach modail a thomhas cuideachd agus a dhealbhadh mar lùb.Ma ruigeas an lùb a’ phuing as àirde a’ comharrachadh an luach AUC as àirde, stadaidh am pròiseas àireamhachaidh agus thathas den bheachd gur e am modail an tagraiche as fheàrr.Chaidh modalan lùbte ROC 1-, 3- agus 5-bliadhna a thogail.Chaidh mion-sgrùdaidhean ath-thionndaidh univariate agus multivariate a chleachdadh gus sgrùdadh a dhèanamh air coileanadh ro-innse neo-eisimeileach a’ mhodail cunnairt prognostic.
Cleachd seachd innealan gus sgrùdadh a dhèanamh air ìrean in-shìoladh cealla dìon, a’ toirt a-steach XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS, agus CIBERSORT.Chaidh dàta in-shìoladh cealla dìonachd a luchdachadh sìos bho stòr-dàta TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3).Chaidh an eadar-dhealachadh ann an susbaint cheallan in-shìoladh dìonach eadar na buidhnean le cunnart àrd agus ìosal den mhodail thogte a sgrùdadh a’ cleachdadh deuchainn inbhe soidhnichte Wilcoxon, tha na toraidhean air an sealltainn anns a’ ghraf ceàrnagach.Chaidh mion-sgrùdadh co-dhàimh Spearman a dhèanamh gus sgrùdadh a dhèanamh air a’ cheangal eadar luachan sgòr cunnairt agus ceallan in-shìoladh dìonach.Tha an co-èifeachd co-dhàimh mar thoradh air a nochdadh mar lollipop.Chaidh an stairsneach cudromachd a shuidheachadh aig p <0.05.Chaidh am modh-obrach a dhèanamh a’ cleachdadh a’ phacaid R ggplot2.Gus sgrùdadh a dhèanamh air a’ cheangal eadar am modail agus ìrean faireachdainn gine co-cheangailte ris an ìre in-shìoladh cealla dìon, rinn sinn am pasgan ggstatsplot agus fradharc cuilbheart fìdhle.
Gus measadh a dhèanamh air pàtrain làimhseachaidh clionaigeach airson aillse pancreatic, rinn sinn cunntas air an IC50 de dhrogaichean chemotherapy a chleachdar gu cumanta anns a’ bhuidheann TCGA-PAAD.Chaidh coimeas a dhèanamh eadar eadar-dhealachaidhean ann an leth-chruinneachaidhean bacaidh (IC50) eadar buidhnean le cunnart àrd is ìosal a’ cleachdadh deuchainn inbhe soidhnichte Wilcoxon, agus tha na toraidhean air an sealltainn mar bogsaichean-bogsa air an gineadh a’ cleachdadh pRRophetic agus ggplot2 ann an R. Bidh a h-uile modh a’ cumail ri stiùiridhean agus gnàthasan iomchaidh.
Tha sruth-obrach an sgrùdaidh againn ri fhaicinn ann am Figear 1. A’ cleachdadh mion-sgrùdadh co-dhàimh eadar lncRNAs agus ginean co-cheangailte ri dìonachd, thagh sinn 724 irlncRNAn le p <0.01 agus r> 0.4.Rinn sinn an uairsin mion-sgrùdadh air na lncRNAn a chaidh an cur an cèill gu eadar-dhealaichte de GEPIA2 (Figear 2A).Chaidh 223 irlncRNAn gu h-iomlan a chuir an cèill gu eadar-dhealaichte eadar adenocarcinoma pancreatic agus clò pancreatic àbhaisteach (| logFC |> 1, FDR <0.05), ainmichte DEirlncRNAs.
Togail mhodalan cunnart ro-innseach.(A) Cuilbheart bholcàno de lncRNAn air an cur an cèill gu eadar-dhealaichte.(B) Sgaoileadh co-èifeachdan lasso airson 20 paidhir DEirlncRNA.(C) Caochladh pàirt de choltas ann an cuairteachadh co-èifeachd LASSO.(D) Cuilbheart coille a’ sealltainn mion-sgrùdadh air ais-aisig air 20 paidhir DEirlncRNA.
An uairsin thog sinn matrix 0 no 1 le bhith a’ càradh 223 DEirlncRNAn.Chaidh 13,687 paidhrichean DEirlncRNA gu h-iomlan a chomharrachadh.Às deidh mion-sgrùdadh ath-thionndaidh univariate agus lasso, chaidh paidhrichean 20 DEirlncRNA a dhearbhadh mu dheireadh gus modal cunnart prognostic a thogail (Figear 2B-D).Stèidhichte air toraidhean Lasso agus mion-sgrùdadh ioma-ais-tharraing, rinn sinn cunntas air sgòr cunnairt airson gach euslainteach anns a’ bhuidheann TCGA-PAAD (Clàr 1).Stèidhichte air toraidhean mion-sgrùdadh lasso air ais, rinn sinn cunntas air sgòr cunnairt airson gach euslainteach anns a’ bhuidheann TCGA-PAAD.B’ e 0.905 an ìre AUC den lùb ROC airson ro-innse modail cunnart 1-bliadhna, 0.942 airson an ro-innse 2-bliadhna, agus 0.966 airson an ro-innse 3-bliadhna (Figear 3A-B).Shuidhich sinn an luach gearraidh as fheàrr de 3.105, shàraich sinn euslaintich TCGA-PAAD gu buidhnean le cunnart àrd is ìosal, agus dhealbhaich sinn na toraidhean mairsinn agus sgaoilidhean sgòr cunnairt airson gach euslainteach (Figear 3C-E).Sheall mion-sgrùdadh Kaplan-Meier gu robh mairsinn euslaintich PAAD anns a’ bhuidheann àrd-chunnart gu math nas ìsle na mairsinneachd euslaintich sa bhuidheann le cunnart ìosal (p <0.001) (Figear 3F).
Dligheachas nam modalan cunnairt prognostic.(A) ROC den mhodail cunnart prognostic.(B) Modalan cunnart prognostic ROC 1-, 2-, agus 3-bliadhna.(C) ROC de mhodail cunnart prognostic.A’ sealltainn an àite gearraidh as fheàrr.(DE) Sgaoileadh inbhe mairsinn (D) agus sgòran cunnairt (E).(F) Mion-sgrùdadh Kaplan-Meier air euslaintich PAAD ann am buidhnean le cunnart àrd is ìosal.
Rinn sinn measadh a bharrachd air eadar-dhealachaidhean ann an sgòran cunnairt a rèir feartan clionaigeach.Tha an cuilbheart stiall (Figear 4A) a’ sealltainn an dàimh iomlan eadar feartan clionaigeach agus sgòran cunnairt.Gu sònraichte, bha sgòran cunnairt nas àirde aig euslaintich nas sine (Figear 4B).A bharrachd air an sin, bha sgòran cunnairt nas àirde aig euslaintich le ìre II na euslaintich le ìre I (Figear 4C).A thaobh ìre tumhair ann an euslaintich PAAD, bha sgòran cunnairt nas àirde aig euslaintich ìre 3 na euslaintich ìre 1 agus 2 (Figear 4D).Rinn sinn tuilleadh mion-sgrùdaidhean ath-thionndaidh univariate agus multivariate agus sheall sinn gu robh sgòr cunnairt (p <0.001) agus aois (p = 0.045) nam factaran prognostic neo-eisimeileach ann an euslaintich le PAAD (Figear 5A-B).Sheall an lùb ROC gu robh an sgòr cunnairt nas fheàrr na feartan clionaigeach eile ann a bhith a’ ro-innse mairsinn 1-, 2-, agus 3-bliadhna euslaintich le PAAD (Figear 5C-E).
Feartan clionaigeach de mhodalan cunnart prognostic.Tha histogram (A) a’ sealltainn (B) aois, (C) ìre tumhair, (D) ìre tumhair, sgòr cunnairt, agus gnè euslaintich anns a’ bhuidheann TCGA-PAAD.**p <0.01
Mion-sgrùdadh ro-innse neo-eisimeileach air modalan cunnart prognostic.(AB) Mion-sgrùdaidhean ath-tharraing Univariate (A) agus multivariate (B) de mhodalan cunnairt prognostic agus feartan clionaigeach.(CE) ROC 1-, 2-, agus 3-bliadhna airson modalan cunnairt prognostic agus feartan clionaigeach
Mar sin, rinn sinn sgrùdadh air a’ cheangal eadar ùine agus sgòran cunnairt.Fhuair sinn a-mach gu robh sgòr cunnairt ann an euslaintich PAAD air a cho-cheangal gu cas le ceallan CD8 + T agus ceallan NK (Figear 6A), a’ nochdadh gnìomh dìon a chaidh a chumail fodha anns a’ bhuidheann àrd-chunnart.Rinn sinn measadh cuideachd air an eadar-dhealachadh ann an in-shìoladh cealla dìon eadar na buidhnean le cunnart àrd agus ìosal agus lorg sinn na h-aon toraidhean (Figear 7).Bha nas lugha de shìoladh de cheallan CD8+ T agus de cheallan NK anns a’ bhuidheann àrd-chunnart.Anns na beagan bhliadhnaichean a dh ’fhalbh, chaidh luchd-dìon puing-dìon (ICI) a chleachdadh gu farsaing ann a bhith a’ làimhseachadh tumors cruaidh.Ach, is ann ainneamh a tha cleachdadh ICIn ann an aillse pancreatic air a bhith soirbheachail.Mar sin, rinn sinn measadh air mar a tha ginean puing-dìon dìonach ann am buidhnean le cunnart àrd is ìosal.Lorg sinn gu robh CTLA-4 agus CD161 (KLRB1) ro mhòr anns a’ bhuidheann le cunnart ìosal (Figear 6B-G), a’ nochdadh gum faodadh euslaintich PAAD anns a’ bhuidheann le cunnart ìosal a bhith mothachail do ICI.
Mion-sgrùdadh co-dhàimh air modal cunnart prognostic agus in-shìoladh cealla dìon.(A) Co-dhàimh eadar modal cunnart prognostic agus in-shìoladh cealla dìon.(BG) A’ nochdadh faireachdainn gine ann am buidhnean le cunnart àrd is ìosal.(HK) Luachan IC50 airson drogaichean sònraichte an aghaidh aillse ann am buidhnean le cunnart àrd is ìosal.*p <0.05, **p <0.01, ns = chan eil e cudromach
Rinn sinn tuilleadh measadh air a’ cheangal eadar sgòran cunnairt agus riochdairean chemotherapy cumanta anns a’ bhuidheann TCGA-PAAD.Rannsaich sinn airson drogaichean anticancer a chleachdar gu cumanta ann an aillse pancreatic agus rinn sinn mion-sgrùdadh air eadar-dhealachaidhean anns na luachan IC50 aca eadar buidhnean le cunnart àrd agus ìosal.Sheall na co-dhùnaidhean gu robh luach IC50 AZD.2281 (olaparib) nas àirde anns a 'bhuidheann àrd-chunnart, a' comharrachadh gum faodadh euslaintich PAAD anns a 'bhuidheann àrd-chunnart a bhith an aghaidh làimhseachadh AZD.2281 (Figear 6H).A bharrachd air an sin, bha luachan IC50 paclitaxel, sorafenib, agus erlotinib nas ìsle anns a’ bhuidheann àrd-chunnart (Figear 6I-K).Chomharraich sinn tuilleadh dhrogaichean anticancer 34 le luachan IC50 nas àirde anns a ’bhuidheann àrd-chunnart agus drogaichean anticancer 34 le luachan IC50 nas ìsle anns a’ bhuidheann àrd-chunnart (Clàr 2).
Chan urrainnear a dhol às àicheadh gu bheil lncRNAn, mRNAn, agus miRNAn ann gu farsaing agus gu bheil pàirt deatamach aca ann an leasachadh aillse.Tha fianais gu leòr ann a tha a’ toirt taic do dhreuchd chudromach mRNA no miRNA ann a bhith a’ ro-innse mairsinneachd iomlan ann an grunn sheòrsan aillse.Gun teagamh, tha mòran mhodalan cunnart prognostic cuideachd stèidhichte air lncRNAn.Mar eisimpleir, tha Luo et al.Tha sgrùdaidhean air sealltainn gu bheil prìomh àite aig LINC01094 ann an iomadachadh PC agus meatastasis, agus tha faireachdainn àrd de LINC01094 a’ nochdadh droch mairsinneachd euslaintich aillse pancreatic [16].Tha an sgrùdadh a thug Lin et al.Tha sgrùdaidhean air sealltainn gu bheil ìsleachadh lncRNA FLVCR1-AS1 co-cheangailte ri droch prognosis ann an euslaintich aillse pancreatic [17].Ach, chan eilear a’ bruidhinn air lncRNAn co-cheangailte ri dìonachd a thaobh a bhith a’ ro-innse mairsinneachd iomlan euslaintich aillse.O chionn ghoirid, chaidh mòran obrach a chuimseachadh air modalan cunnairt prognostic a thogail gus ro-innse a dhèanamh air mairsinn euslaintich aillse agus mar sin dòighean làimhseachaidh atharrachadh [18, 19, 20].Tha aithne a’ sìor fhàs air àite cudromach in-shìoladh dìonachd ann an tòiseachadh aillse, adhartas, agus freagairt do leigheasan leithid chemotherapy.Tha grunn sgrùdaidhean air dearbhadh gu bheil àite deatamach aig ceallan dìon a tha a’ toirt a-steach tumhair anns an fhreagairt do chemotherapy cytotoxic [21, 22, 23].Tha meanbh-àrainneachd dìonachd tumhair na fheart cudromach ann am mairsinn euslaintich tumhair [24, 25].Tha immunotherapy, gu sònraichte leigheas ICI, air a chleachdadh gu farsaing ann an làimhseachadh tumhan cruaidh [26].Tha ginean co-cheangailte ri dìonachd air an cleachdadh gu farsaing gus modalan cunnart prognostic a thogail.Mar eisimpleir, Su et al.Tha am modail cunnart prognostic co-cheangailte ri dìon stèidhichte air ginean còd pròtain gus ro-innse euslaintich aillse ovarian [27].Tha ginean neo-chòdachadh leithid lncRNAn cuideachd freagarrach airson modalan cunnart prognostic a thogail [28, 29, 30].Rinn Luo et al deuchainn air ceithir lncRNAn co-cheangailte ri dìonachd agus thog e modal ro-innse airson cunnart aillse broilleach [31].Khan et al.Chaidh 32 ath-sgrìobhaidhean eadar-dhealaichte a chomharrachadh gu h-iomlan, agus stèidhichte air seo, chaidh modal ro-innse le 5 tar-sgrìobhaidhean cudromach a stèidheachadh, a chaidh a mholadh mar inneal air a mholadh gu mòr airson a bhith a’ ro-innse diùltadh gann dearbhte le biopsy às deidh tar-chuir dubhaig [32].
Tha a’ mhòr-chuid de na modailean sin stèidhichte air ìrean faireachdainn gine, an dàrna cuid ginean còdaidh pròtain no ginean neo-chòdachadh.Ach, faodaidh luachan faireachdainn eadar-dhealaichte a bhith aig an aon ghine ann an genomes eadar-dhealaichte, cruthan dàta agus ann an diofar euslaintich, a ‘leantainn gu tuairmsean neo-sheasmhach ann am modalan ro-innseach.Anns an sgrùdadh seo, thog sinn modail reusanta le dà phaidhir de lncRNAn, neo-eisimeileach bho na dearbh luachan faireachdainn.
Anns an sgrùdadh seo, chomharraich sinn irlncRNA airson a’ chiad uair tro mhion-sgrùdadh co-dhàimh le ginean co-cheangailte ri dìonachd.Rinn sinn sgrìonadh air 223 DEirlncRNAn le tar-chur le lncRNAn air an cur an cèill gu eadar-dhealaichte.San dàrna h-àite, thog sinn matrix 0-or-1 stèidhichte air an dòigh paidhir DEirlncRNA foillsichte [31].Rinn sinn an uairsin mion-sgrùdaidhean ath-thionndaidh univariate agus lasso gus paidhrichean DEirlncRNA prognostic a chomharrachadh agus modal cunnairt ro-innseach a thogail.Rinn sinn tuilleadh mion-sgrùdadh air a’ cheangal eadar sgòran cunnairt agus feartan clionaigeach ann an euslaintich le PAAD.Lorg sinn gum faod ar modal cunnairt prognostic, mar fhactar prognostic neo-eisimeileach ann an euslaintich PAAD, eadar-dhealachadh èifeachdach a dhèanamh eadar euslaintich àrd-ìre bho euslaintich aig ìre ìosal agus euslaintich àrd-ìre bho euslaintich aig ìre ìosal.A bharrachd air an sin, b ’e luachan AUC lùb ROC a’ mhodail cunnart prognostic 0.905 airson an ro-aithris 1-bliadhna, 0.942 airson an ro-aithris 2-bliadhna, agus 0.966 airson an ro-aithris 3-bliadhna.
Thuirt luchd-rannsachaidh gu robh euslaintich le in-shìoladh cealla CD8 + T nas àirde nas mothachaile do làimhseachadh ICI [33].Is dòcha gur e àrdachadh ann an susbaint cheallan cytotoxic, ceallan CD56 NK, ceallan NK agus ceallan CD8 + T ann am meanbh-àrainneachd dìonachd tumhair aon de na h-adhbharan airson buaidh suppressive tumhair [34].Sheall sgrùdaidhean roimhe gu robh ìrean nas àirde de CD4 (+) T agus CD8 (+) T a bha a’ toirt a-steach tumhair ceangailte gu mòr ri mairsinn nas fhaide [35].Tha droch shìoladh cealla CD8 T, luchd neoantigen ìosal, agus meanbh-àrainneachd tumhair fìor dìonach a’ leantainn gu dìth freagairt do leigheas ICI [36].Fhuair sinn a-mach gu robh sgòr cunnairt air a cheangal gu h-àicheil le ceallan CD8 + T agus ceallan NK, a’ nochdadh gur dòcha nach biodh euslaintich le sgòran àrd-chunnart freagarrach airson làimhseachadh ICI agus gu bheil prognosis nas miosa aca.
Tha CD161 na chomharradh air ceallan marbhadh nàdarra (NK).CD8 + CD161 + CAR-transduced T ceallan meadhanach air an àrdachadh ann an èifeachd antitumor vivo ann am modalan xenograft adenocarcinoma ductal pancreatic HER2 + [37].Bidh luchd-bacadh puing-seic dìonach ag amas air pròtain co-cheangailte ri lymphocyte T cytotoxic 4 (CTLA-4) agus pròtain bàs cealla prògramaichte 1 (PD-1) / ligand bàs cealla prògramaichte 1 (PD-L1) slighean agus tha comas mòr aca ann am mòran raointean.Tha cur an cèill CTLA-4 agus CD161 (KLRB1) nas ìsle ann am buidhnean àrd-chunnart, a’ nochdadh tuilleadh gur dòcha nach bi euslaintich le sgòran àrd-chunnart airidh air làimhseachadh ICI.[38]
Gus roghainnean làimhseachaidh a lorg a tha iomchaidh airson euslaintich le cunnart àrd, rinn sinn mion-sgrùdadh air diofar dhrogaichean anticancer agus lorg sinn gum faodadh paclitaxel, sorafenib, agus erlotinib, a tha air an cleachdadh gu farsaing ann an euslaintich le PAAD, a bhith freagarrach airson euslaintich le cunnart àrd le PAAD.[33].Lorg Zhang et al gum faod mùthaidhean ann an slighe freagairt milleadh DNA sam bith (DDR) leantainn gu droch prognosis ann an euslaintich aillse prostate [39].Sheall an deuchainn aillse Pancreatic Olaparib Leantainneach (POLO) gun robh làimhseachadh cumail suas le olaparib beò gun adhartas fada an coimeas ri placebo às deidh chemotherapy stèidhichte air platinum aig a’ chiad loidhne ann an euslaintich le adenocarcinoma ductal pancreatic agus mùthaidhean germline BRCA1 / 2 [40].Tha seo a’ toirt dòchas mòr gun tig piseach mòr air toraidhean làimhseachaidh anns an fho-bhuidheann seo de dh’ euslaintich.Anns an sgrùdadh seo, bha luach IC50 AZD.2281 (olaparib) na b 'àirde anns a' bhuidheann àrd-chunnart, a 'sealltainn gum faodadh euslaintich PAAD anns a' bhuidheann àrd-chunnart a bhith an aghaidh làimhseachadh le AZD.2281.
Bheir na modailean ro-innse san sgrùdadh seo toraidhean ro-innse math, ach tha iad stèidhichte air ro-innsean anailis.Tha mar a dhearbhas tu na toraidhean sin le dàta clionaigeach na cheist chudromach.Tha ultrasonography miann snàthad endoscopic (EUS-FNA) air a thighinn gu bhith na dhòigh riatanach airson a bhith a’ lorg leòintean pancreatic cruaidh agus extrapancreatic le cugallachd de 85% agus sònrachas 98% [41].Tha teachd snàthadan biopsy snàthad mìn EUS (EUS-FNB) stèidhichte sa mhòr-chuid air buannachdan a thathas a’ faicinn thairis air FNA, leithid cruinneas breithneachaidh nas àirde, faighinn sampaill a ghlèidheas structar eachdraidheil, agus mar sin a’ gineadh clò dìon a tha riatanach airson breithneachadh sònraichte.staining sònraichte [42].Dhearbh sgrùdadh eagarach air an litreachas gu bheil snàthadan FNB (gu sònraichte 22G) a’ nochdadh an èifeachd as àirde ann a bhith a’ buain clò bho mhòran pancreatic [43].Gu clionaigeach, chan eil ach àireamh bheag de dh’ euslaintich airidh air obair-lannsa radaigeach, agus tha tumhan neo-obrachail aig a’ mhòr-chuid de dh’euslaintich aig àm a’ chiad bhreithneachadh.Ann an cleachdadh clionaigeach, chan eil ach cuid bheag de dh’ euslaintich freagarrach airson obair-lannsa radaigeach leis gu bheil tumhan neo-obrachail aig a’ mhòr-chuid de dh’euslaintich aig àm a’ chiad bhreithneachadh.Às deidh dearbhadh pathological le EUS-FNB agus dòighean eile, mar as trice bidh làimhseachadh neo-lèigheil àbhaisteach leithid chemotherapy air a thaghadh.Tha am prògram rannsachaidh againn às deidh sin gu bhith a’ dèanamh deuchainn air modal prognostic an sgrùdaidh seo ann an buidhnean lannsaireachd agus neo-lannsa tro sgrùdadh ath-shealladh.
Gu h-iomlan, stèidhich an sgrùdadh againn modal cunnart prognostic ùr stèidhichte air irlncRNA càraideach, a sheall luach prognostic gealltanach ann an euslaintich le aillse pancreatic.Dh’ fhaodadh ar modal cunnairt prognostic cuideachadh le bhith ag eadar-dhealachadh euslaintich le PAAD a tha freagarrach airson làimhseachadh meidigeach.
Gheibhear na stòran-dàta a chaidh a chleachdadh agus a mhion-sgrùdadh san sgrùdadh làithreach bhon ùghdar iomchaidh ma thèid iarraidh reusanta.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Dreuchd eadar-mheadhanach fèin-èifeachdas ann an riaghladh tòcail air faireachdainnean àicheil rè galar lèir-sgaoilte COVID-19: sgrùdadh tar-roinneil.Int J Ment Health Nurs [artaigil iris].2021 06/01/2021; 30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J, et al.Beachdan buill teaghlaich air co-dhùnaidhean eile ann an aonadan cùram dian: ath-sgrùdadh eagarach.INT J NURS STUD [artaigil iris;lèirmheas].2023 01/01/2023; 137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Aillse pancreatic.Lancet.[Artaigil iris;taic rannsachaidh, NIH, extramural;taic rannsachaidh, riaghaltas taobh a-muigh nan SA;lèirmheas].2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Epidemio-eòlas aillse pancreatic.World Journal of Gastroenterology.[Artaigil iris, lèirmheas].2016 11/28/2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Ainmeagram ùr co-cheangailte ri tp53 airson ro-innse mairsinneachd iomlan ann an euslaintich le aillse pancreatic.BMC Cancer [artaigil iris].2021 31-03-2021; 21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Buaidh leigheas stèidhichte air fuasgladh air sgìths co-cheangailte ri aillse ann an euslaintich aillse colorectal a’ faighinn chemotherapy: deuchainn fo smachd air thuaiream.Banaltram aillse.[Artaigil iris;deuchainn fo smachd air thuaiream;tha an sgrùdadh a’ faighinn taic bho riaghaltas taobh a-muigh nan Stàitean Aonaichte].2022 05/01/2022; 45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y, et al.Bidh ìrean antigen carcinoembryonic postoperative (CEA) a ’ro-innse toradh às deidh resection aillse colorectal ann an euslaintich le ìrean àbhaisteach CEA ro-ghnìomhach.Ionad airson Rannsachadh Aillse Eadar-theangachaidh.[Artaigil iris].2020 01.01.2020; 9(1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X, et al.Bidh lncRNAn co-cheangailte ri dìonachd a’ gineadh ainmean-sgrìobhte ùra agus a’ ro-innse cruth-tìre dìonach carcinoma hepatocellular daonna.Mol Ther Aigéid niuclasach [Artaigil iris].2020 2020-12-04; 22: 937 - 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Immunotherapy airson aillse pancreatic: cnapan-starra agus adhartasan.Ann Gastrointestinal Surgeon [Journal Article;lèirmheas].2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. RNAn fada gun chòdachadh (LncRNAn), genomics tumhair viral agus tachartasan splicing neo-sheasmhach: builean teirpeach.AM J CANCER RES [artaigil iris;lèirmheas].2021 01/20/2021; 11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Comharrachadh ainmean-sgrìobhte lncRNA co-cheangailte ri prognosis aillse endometrial.Coileanaidhean saidheans [artaigil iris].2021 2021-01-01; 104(1): 311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S, et al.Mion-sgrùdadh coileanta air ginean prognostic pròtain ceangail RNA agus tagraichean dhrogaichean ann an carcinoma cealla dubhaig cealla papillary.pregen.[Artaigil iris].2021 01/20/2021; 12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, et al.Tha feartan RNA fada neo-chòdadh co-cheangailte ri autophagy a’ ro-innse prognosis aillse broilleach.pregen.[Artaigil iris].2021 01/20/2021; 12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Immune co-cheangailte ri sia lncRNA ainm-sgrìobhte a 'leasachadh prognosis ann an glioblastoma multiforme.MOL Neurobiology.[Artaigil iris].2018 01.05.2018; 55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z, et al.Tha ainm-sgrìobhte ùr trì-lncRNA a’ ro-innse gum mair euslaintich le aillse pancreatic.RIAGHAILTEAN ONKOL.[Artaigil iris].2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. Tha LINC01094 a’ brosnachadh adhartas aillse pancreatic le bhith a’ riaghladh abairt LIN28B agus slighe PI3K/AKT tro sponged miR-577.Mol Therapeutics - Aigéid niuclasach.2021; 26: 523-35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, et al.Faodaidh fios air ais adhartach eadar lncRNA FLVCR1-AS1 agus KLF10 bacadh a chur air adhartas aillse pancreatic tro shlighe PTEN / AKT.J EXP Clin Cancer Res.2021; 40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Comharrachadh trì ginean deug a’ ro-innse mairsinneachd iomlan ann an carcinoma hepatocellular.Riochdaire Biosci [artaigil iris].2021 04/09/2021.
Ùine puist: Sultain-22-2023