’S e aillse pancreatic aon de na tumhair as marbhtaiche san t-saoghal le droch ro-innse. Mar sin, tha feum air modail ro-innse ceart gus euslaintich a chomharrachadh a tha ann an cunnart mòr aillse pancreatic gus làimhseachadh a dhealbhadh agus ro-innse nan euslaintich sin a leasachadh.
Fhuair sinn dàta RNAseq adenocarcinoma pancreatic (PAAD) bho The Cancer Genome Atlas (TCGA) bhon stòr-dàta UCSC Xena, chomharraich sinn lncRNAs co-cheangailte ri dìonachd (irlncRNAs) tro mhion-sgrùdadh co-dhàimh, agus chomharraich sinn eadar-dhealachaidhean eadar TCGA agus clò adenocarcinoma pancreatic àbhaisteach. DEirlncRNA) bho TCGA agus abairt clò genotype (GTEx) de chlò pancreatic. Chaidh tuilleadh mhion-sgrùdaidhean ath-tharraing aon-atharrachail agus lasso a dhèanamh gus modalan ainm-sgrìobhte prognosach a thogail. An uairsin thomhais sinn an raon fon lùb agus cho-dhùin sinn an luach gearraidh as fheàrr airson euslaintich le adenocarcinoma pancreatic àrd- agus ìosal-chunnart a chomharrachadh. Gus coimeas a dhèanamh eadar feartan clionaigeach, in-shìoladh cealla dìonachd, meanbh-àrainneachd dìonachd-bhacadhach, agus strì an aghaidh chemotherapy ann an euslaintich le aillse pancreatic àrd- agus ìosal-chunnart.
Chomharraich sinn 20 paidhir DEirlncRNA agus chuir sinn euslaintich ann am buidhnean a rèir an luach gearraidh as fheàrr. Sheall sinn gu bheil coileanadh cudromach aig ar modail ainm-sgrìobhte prognosis ann a bhith a’ ro-innse prognosis euslaintich le PAAD. Tha AUC lùb ROC 0.905 airson an ro-aithris 1-bliadhna, 0.942 airson an ro-aithris 2-bliadhna, agus 0.966 airson an ro-aithris 3-bliadhna. Bha ìrean mairsinn nas ìsle agus feartan clionaigeach nas miosa aig euslaintich àrd-chunnart. Sheall sinn cuideachd gu bheil siostaman dìon lag ann an euslaintich àrd-chunnart agus gum faodadh iad strì an aghaidh immunotherapy a leasachadh. Is dòcha gum bi measadh air drogaichean an-aghaidh aillse leithid paclitaxel, sorafenib, agus erlotinib stèidhichte air innealan ro-innse coimpiutaireachd iomchaidh airson euslaintich àrd-chunnart le PAAD.
Gu h-iomlan, stèidhich an sgrùdadh againn modail cunnairt prognosach ùr stèidhichte air irlncRNA càraideach, a sheall luach prognosach gealltanach ann an euslaintich le aillse pancreatic. Dh’ fhaodadh ar modail cunnairt prognosach cuideachadh le bhith a’ comharrachadh euslaintich le PAAD a tha freagarrach airson làimhseachadh meidigeach.
Tha aillse pancreatic na tumhair malignant le ìre mairsinn ìosal còig bliadhna agus ìre àrd. Aig àm an dearbhaidh, tha a’ mhòr-chuid de dh’euslaintich mu thràth ann an ìrean adhartach. Ann an co-theacsa galar lèir-sgaoilte COVID-19, tha dotairean agus banaltraman fo chuideam mòr nuair a bhios iad a’ làimhseachadh euslaintich le aillse pancreatic, agus tha teaghlaichean euslaintich cuideachd an aghaidh iomadh cuideam nuair a bhios iad a’ dèanamh cho-dhùnaidhean làimhseachaidh [1, 2]. Ged a chaidh adhartasan mòra a dhèanamh ann an làimhseachadh DOADan, leithid leigheas neoadjuvant, resection lannsaichte, leigheas rèididheachd, chemotherapy, leigheas moileciuil targaideach, agus luchd-bacadh puing-sgrùdaidh dìonachd (ICIs), chan eil ach mu 9% de dh’euslaintich beò còig bliadhna às deidh an dearbhaidh [3], 4]. Leis gu bheil na comharran tràtha de adenocarcinoma pancreatic neo-àbhaisteach, mar as trice bidh euslaintich air an dearbhadh le metastases aig ìre adhartach [5]. Mar sin, airson euslainteach sònraichte, feumaidh làimhseachadh coileanta fa leth na buannachdan agus na h-eas-bhuannachdan a tha aig gach roghainn làimhseachaidh a thomhas, chan ann a-mhàin gus mairsinn a leudachadh, ach cuideachd gus càileachd beatha a leasachadh [6]. Mar sin, tha feum air modail ro-innse èifeachdach gus measadh ceart a dhèanamh air ro-innse euslaintich [7]. Mar sin, faodar làimhseachadh iomchaidh a thaghadh gus cothromachadh a dhèanamh eadar mairsinneachd agus càileachd beatha euslaintich le PAAD.
Tha droch ro-innse PAAD gu ìre mhòr mar thoradh air strì an aghaidh dhrogaichean chemotherapy. Anns na bliadhnachan mu dheireadh, chaidh luchd-bacadh puing-sgrùdaidh dìonachd a chleachdadh gu farsaing ann an làimhseachadh tumhair chruaidh [8]. Ach, is ann ainneamh a bhios cleachdadh ICIn ann an aillse pancreatic soirbheachail [9]. Mar sin, tha e cudromach euslaintich a chomharrachadh a dh’ fhaodadh buannachd fhaighinn bho leigheas ICI.
'S e seòrsa de RNA neo-chòdaidh a th' ann an RNA fada neo-chòdaidh (lncRNA) le tar-sgrìobhaidhean >200 niùclasaid. Tha lncRNAs farsaing agus tha iad a’ dèanamh suas mu 80% den tar-sgrìobhadh daonna [10]. Tha mòran obrach air sealltainn gum faod modalan prognosach stèidhichte air lncRNA ro-innse gu h-èifeachdach ro-innse euslaintich [11, 12]. Mar eisimpleir, chaidh 18 lncRNAs co-cheangailte ri autophagy a chomharrachadh gus soidhnichean prognosach a ghineadh ann an aillse broilleach [13]. Chaidh sia lncRNAs eile co-cheangailte ri dìonachd a chleachdadh gus feartan prognosach glioma a stèidheachadh [14].
Ann an aillse pancreatic, tha cuid de sgrùdaidhean air soidhnichean stèidhichte air lncRNA a stèidheachadh gus ro-innse prognosis euslaintich. Chaidh soidhne 3-lncRNA a stèidheachadh ann an adenocarcinoma pancreatic le farsaingeachd fo lùb ROC (AUC) de dìreach 0.742 agus mairsinneachd iomlan (OS) de 3 bliadhna [15]. A bharrachd air an sin, tha luachan abairt lncRNA ag atharrachadh am measg diofar genomes, diofar chruthan dàta, agus diofar euslaintich, agus tha coileanadh a’ mhodail ro-innseach neo-sheasmhach. Mar sin, bidh sinn a’ cleachdadh algairim modaladh ùr, paidhreachadh agus ath-aithris, gus soidhnichean lncRNA co-cheangailte ri dìonachd (irlncRNA) a ghineadh gus modail ro-innseach nas cruinne agus nas seasmhaiche a chruthachadh [8].
Fhuaireadh dàta RNAseq àbhaisteach (FPKM) agus dàta TCGA aillse pancreatic clionaigeach agus dàta abairt clò genotype (GTEx) bhon stòr-dàta UCSC XENA (https://xenabrowser.net/datapages/). Fhuaireadh faidhlichean GTF bhon stòr-dàta Ensembl (http://asia.ensembl.org) agus chaidh an cleachdadh gus pròifilean abairt lncRNA a thoirt a-mach à RNAseq. Luchdaich sinn sìos ginean co-cheangailte ri dìonachd bhon stòr-dàta ImmPort (http://www.immport.org) agus chomharraich sinn lncRNAs co-cheangailte ri dìonachd (irlncRNAs) a’ cleachdadh mion-sgrùdadh co-dhàimh (p < 0.001, r > 0.4). Chomharrachadh irlncRNAs a chaidh a chur an cèill gu eadar-dhealaichte (DEirlncRNAs) le bhith a’ dol tarsainn air irlncRNAs agus lncRNAs a chaidh a chur an cèill gu eadar-dhealaichte a fhuaireadh bhon stòr-dàta GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) anns a’ chohort TCGA-PAAD (|logFC| > 1 agus FDR) <0.05).
Chaidh an dòigh seo aithris roimhe [8]. Gu sònraichte, bidh sinn a’ togail X gus an lncRNA A agus lncRNA B paidhir a chur an àite. Nuair a tha luach abairt lncRNA A nas àirde na luach abairt lncRNA B, tha X air a mhìneachadh mar 1, air dhòigh eile tha X air a mhìneachadh mar 0. Mar sin, is urrainn dhuinn maitrís de 0 no – 1 fhaighinn. Tha ais dhìreach a’ mhaitrís a’ riochdachadh gach sampall, agus tha an ais chòmhnard a’ riochdachadh gach paidhir DEirlncRNA le luach de 0 no 1.
Chaidh mion-sgrùdadh ath-tharraing aon-atharrachail agus an uair sin ath-tharraing Lasso a chleachdadh gus sgrìonadh a dhèanamh air paidhrichean DEirlncRNA prognosach. Chleachd am mion-sgrùdadh ath-tharraing lasso dearbhadh-crois 10-fhillte air ath-aithris 1000 uair (p < 0.05), le 1000 brosnachadh air thuaiream gach ruith. Nuair a chaidh tricead gach paidhir DEirlncRNA thairis air 100 uair ann an 1000 cearcall, chaidh paidhrichean DEirlncRNA a thaghadh gus modail cunnairt prognosach a thogail. An uairsin chleachd sinn lùb AUC gus an luach gearraidh as fheàrr a lorg airson euslaintich PAAD a sheòrsachadh ann am buidhnean àrd-chunnart agus ìosal-chunnart. Chaidh luach AUC gach modail obrachadh a-mach cuideachd agus a phlòtadh mar lùb. Ma ruigeas an lùb a’ phuing as àirde a’ comharrachadh an luach AUC as àirde, stadaidh am pròiseas àireamhachaidh agus thathas den bheachd gur e am modail an tagraiche as fheàrr. Chaidh modalan lùb ROC 1-, 3- agus 5-bliadhna a thogail. Chaidh mion-sgrùdaidhean ath-tharraing aon-atharrachail agus ioma-atharrachail a chleachdadh gus sgrùdadh a dhèanamh air coileanadh ro-innseach neo-eisimeileach a’ mhodail cunnairt prognosach.
Cleachd seachd innealan gus ìrean in-shìoladh cheallan dìonachd a sgrùdadh, nam measg XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS, agus CIBERSORT. Chaidh dàta in-shìoladh cheallan dìonachd a luchdachadh sìos bhon stòr-dàta TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3). Chaidh an diofar ann an susbaint cheallan a tha a’ in-shìoladh dìonachd eadar na buidhnean àrd- agus ìosal-chunnart den mhodail thogte a sgrùdadh a’ cleachdadh deuchainn Wilcoxon le rang ainmichte, tha na toraidhean air an sealltainn anns a’ ghraf cheàrnagach. Chaidh mion-sgrùdadh co-dhàimh Spearman a dhèanamh gus an dàimh eadar luachan sgòr cunnairt agus ceallan a tha a’ in-shìoladh dìonachd a sgrùdadh. Tha an co-èifeachd co-dhàimh a thig às air a shealltainn mar lollipop. Chaidh an stairsneach cudromachd a shuidheachadh aig p < 0.05. Chaidh am modh-obrach a dhèanamh a’ cleachdadh pasgan R ggplot2. Gus sgrùdadh a dhèanamh air an dàimh eadar am modail agus ìrean abairtean gine co-cheangailte ri ìre in-shìoladh cheallan dìonachd, rinn sinn am pasgan ggstatsplot agus lèirsinn plota fidheall.
Gus pàtrain làimhseachaidh clionaigeach airson aillse pancreatic a mheasadh, rinn sinn àireamhachadh air IC50 dhrogaichean chemotherapy a thathas a’ cleachdadh gu cumanta ann an cohort TCGA-PAAD. Chaidh eadar-dhealachaidhean ann an leth-dùmhlachdan bacaidh (IC50) eadar buidhnean àrd-chunnart agus ìosal-chunnart a choimeas a’ cleachdadh deuchainn Wilcoxon signed-rank, agus tha na toraidhean air an sealltainn mar bhogsa-plots a chaidh a chruthachadh a’ cleachdadh pRRophetic agus ggplot2 ann an R. Tha a h-uile dòigh a’ gèilleadh ri stiùiridhean agus gnàthasan buntainneach.
Tha sruth-obrach an sgrùdaidh againn air a shealltainn ann am Figear 1. A’ cleachdadh mion-sgrùdadh co-dhàimh eadar lncRNAs agus ginean co-cheangailte ri dìonachd, thagh sinn 724 irlncRNAs le p < 0.01 agus r > 0.4. An uairsin rinn sinn mion-sgrùdadh air na lncRNAs de GEPIA2 a chaidh an cur an cèill gu eadar-dhealaichte (Figear 2A). Chaidh 223 irlncRNAs gu h-iomlan a chur an cèill gu eadar-dhealaichte eadar adenocarcinoma pancreatic agus clò pancreatic àbhaisteach (|logFC| > 1, FDR < 0.05), air an robh DEirlncRNAs.
Togail mhodalan cunnairt ro-innseach. (A) Plota bholcàno de lncRNAs air an cur an cèill gu eadar-dhealaichte. (B) Sgaoileadh cho-èifeachdan lasso airson 20 paidhir DEirlncRNA. (C) Caochlaideachd pàirteach coltachd an t-sgaoilidh cho-èifeachd LASSO. (D) Plota coille a’ sealltainn mion-sgrùdadh ath-tharraing aon-atharrachail de 20 paidhir DEirlncRNA.
An uair sin, thog sinn maitrís 0 no 1 le bhith a’ paidhreachadh 223 DEirlncRNA. Chaidh 13,687 paidhir DEirlncRNA a chomharrachadh gu h-iomlan. Às dèidh mion-sgrùdadh ath-tharraing aon-atharrachail agus lasso, chaidh 20 paidhir DEirlncRNA a dhearbhadh mu dheireadh gus modail cunnairt ro-innseach a thogail (Figear 2B-D). Stèidhichte air toraidhean mion-sgrùdadh ath-tharraing lasso agus ioma-mhion-sgrùdadh ath-tharraing, thomhais sinn sgòr cunnairt airson gach euslainteach anns a’ chohort TCGA-PAAD (Clàr 1). Stèidhichte air toraidhean mion-sgrùdadh ath-tharraing lasso, thomhais sinn sgòr cunnairt airson gach euslainteach anns a’ chohort TCGA-PAAD. B’ e AUC lùb ROC 0.905 airson ro-innse modail cunnairt 1-bliadhna, 0.942 airson ro-innse 2-bhliadhna, agus 0.966 airson ro-innse 3-bliadhna (Figear 3A-B). Shuidhich sinn luach gearraidh as fheàrr de 3.105, roinn sinn euslaintich cohort TCGA-PAAD ann am buidhnean àrd-chunnart is ìosal-chunnart, agus phlòt sinn na toraidhean mairsinn agus sgaoilidhean sgòr cunnairt airson gach euslainteach (Figear 3C-E). Sheall mion-sgrùdadh Kaplan-Meier gu robh mairsinn euslaintich PAAD sa bhuidheann àrd-chunnart gu math nas ìsle na mairsinn euslaintich sa bhuidheann ìosal-chunnart (p < 0.001) (Figear 3F).
Dligheachd mhodalan cunnairt ro-innseach. (A) ROC a’ mhodail cunnairt ro-innseach. (B) Modalan cunnairt ro-innseach ROC 1-, 2-, agus 3-bliadhna. (C) ROC a’ mhodail cunnairt ro-innseach. A’ sealltainn a’ phuing gearraidh as fheàrr. (DE) Sgaoileadh inbhe mairsinn (D) agus sgòran cunnairt (E). (F) Mion-sgrùdadh Kaplan-Meier air euslaintich PAAD ann am buidhnean àrd- agus ìosal-chunnart.
Rinn sinn measadh a bharrachd air eadar-dhealachaidhean ann an sgòran cunnairt a rèir feartan clionaigeach. Tha am plota stiall (Figear 4A) a’ sealltainn a’ chàirdeis iomlan eadar feartan clionaigeach agus sgòran cunnairt. Gu sònraichte, bha sgòran cunnairt nas àirde aig euslaintich nas sine (Figear 4B). A bharrachd air an sin, bha sgòran cunnairt nas àirde aig euslaintich le ìre II na bha aig euslaintich le ìre I (Figear 4C). A thaobh ìre tumhair ann an euslaintich PAAD, bha sgòran cunnairt nas àirde aig euslaintich ìre 3 na bha aig euslaintich ìre 1 agus 2 (Figear 4D). Rinn sinn a bharrachd air sin mion-sgrùdaidhean ath-tharraing aon-atharrachail agus ioma-atharrachail agus sheall sinn gu robh sgòr cunnairt (p < 0.001) agus aois (p = 0.045) nan factaran prognosach neo-eisimeileach ann an euslaintich le PAAD (Figear 5A-B). Sheall lùb ROC gu robh an sgòr cunnairt nas fheàrr na feartan clionaigeach eile ann a bhith a’ ro-innse mairsinn 1-, 2-, agus 3-bliadhna euslaintich le PAAD (Figear 5C-E).
Feartan clionaigeach mhodalan cunnairt prognosach. Tha histogram (A) a’ sealltainn (B) aois, (C) ìre tumhair, (D) ìre tumhair, sgòr cunnairt, agus gnè euslaintich ann an cohort TCGA-PAAD. **p < 0.01
Mion-sgrùdadh ro-innseach neo-eisimeileach air modalan cunnairt ro-innseach. (AB) Mion-sgrùdaidhean ath-tharraing aon-atharrachail (A) agus ioma-atharrachail (B) air modalan cunnairt ro-innseach agus feartan clionaigeach. (CE) ROC 1-, 2-, agus 3-bliadhna airson modalan cunnairt ro-innseach agus feartan clionaigeach
Mar sin, rinn sinn sgrùdadh air a’ cheangal eadar ùine agus sgòran cunnairt. Fhuair sinn a-mach gu robh sgòr cunnairt ann an euslaintich PAAD co-cheangailte gu neo-dhìreach ri ceallan T CD8+ agus ceallan NK (Figear 6A), a’ nochdadh gnìomh dìonachd fo smachd anns a’ bhuidheann àrd-chunnart. Rinn sinn measadh cuideachd air an eadar-dhealachadh ann an in-shìoladh cealla dìonachd eadar na buidhnean àrd-chunnart agus ìosal-chunnart agus fhuair sinn na h-aon toraidhean (Figear 7). Bha nas lugha de in-shìoladh de cheallan T CD8+ agus ceallan NK anns a’ bhuidheann àrd-chunnart. Anns na bliadhnachan mu dheireadh, chaidh luchd-bacadh puing-sgrùdaidh dìonachd (ICIs) a chleachdadh gu farsaing ann an làimhseachadh tumhair chruaidh. Ach, is ann ainneamh a tha cleachdadh ICIs ann an aillse pancreatic air a bhith soirbheachail. Mar sin, rinn sinn measadh air abairt ginean puing-sgrùdaidh dìonachd ann am buidhnean àrd-chunnart agus ìosal-chunnart. Fhuair sinn a-mach gu robh CTLA-4 agus CD161 (KLRB1) air an cus-chur an cèill anns a’ bhuidheann ìosal-chunnart (Figear 6B-G), a’ nochdadh gum faodadh euslaintich PAAD anns a’ bhuidheann ìosal-chunnart a bhith mothachail air ICI.
Mion-sgrùdadh co-dhàimh air modail cunnairt ro-innseach agus in-shìoladh cealla dìonachd. (A) Co-dhàimh eadar modail cunnairt ro-innseach agus in-shìoladh cealla dìonachd. (BG) A’ comharrachadh abairt gine ann am buidhnean àrd is ìosal cunnairt. (HK) Luachan IC50 airson drogaichean sònraichte an-aghaidh aillse ann am buidhnean àrd is ìosal cunnairt. *p < 0.05, **p < 0.01, ns = gun a bhith cudromach
Rinn sinn measadh a bharrachd air a’ cheangal eadar sgòran cunnairt agus riochdairean chemotherapy cumanta ann an cohort TCGA-PAAD. Rannsaich sinn drogaichean an-aghaidh aillse a thathas a’ cleachdadh gu cumanta ann an aillse pancreatic agus rinn sinn mion-sgrùdadh air eadar-dhealachaidhean anns na luachan IC50 aca eadar buidhnean àrd-chunnart agus ìosal-chunnart. Sheall na toraidhean gu robh luach IC50 AZD.2281 (olaparib) nas àirde anns a’ bhuidheann àrd-chunnart, a’ nochdadh gum faodadh euslaintich PAAD anns a’ bhuidheann àrd-chunnart a bhith an aghaidh làimhseachadh AZD.2281 (Figear 6H). A bharrachd air an sin, bha luachan IC50 paclitaxel, sorafenib, agus erlotinib nas ìsle anns a’ bhuidheann àrd-chunnart (Figear 6I-K). Chomharraich sinn cuideachd 34 droga an-aghaidh aillse le luachan IC50 nas àirde anns a’ bhuidheann àrd-chunnart agus 34 droga an-aghaidh aillse le luachan IC50 nas ìsle anns a’ bhuidheann àrd-chunnart (Clàr 2).
Chan urrainnear àicheadh gu bheil lncRNAs, mRNAs, agus miRNAs ann gu farsaing agus gu bheil pàirt chudromach aca ann an leasachadh aillse. Tha fianais gu leòr ann a tha a’ toirt taic don phàirt chudromach a th’ aig mRNA no miRNA ann a bhith a’ ro-innse mairsinneachd iomlan ann an grunn sheòrsaichean aillse. Gun teagamh, tha mòran mhodalan cunnairt prognosach stèidhichte air lncRNAs cuideachd. Mar eisimpleir, Luo et al. Tha sgrùdaidhean air sealltainn gu bheil pàirt chudromach aig LINC01094 ann am iomadachadh agus metastasis PC, agus tha abairt àrd de LINC01094 a’ nochdadh mairsinneachd bochd euslaintich aillse pancreatic [16]. An sgrùdadh a chuir Lin et al. air adhart Tha sgrùdaidhean air sealltainn gu bheil lùghdachadh lncRNA FLVCR1-AS1 co-cheangailte ri droch prognosis ann an euslaintich aillse pancreatic [17]. Ach, chan eil lncRNAs co-cheangailte ri dìonachd air an deasbad cho mòr a thaobh a bhith a’ ro-innse mairsinneachd iomlan euslaintich aillse. O chionn ghoirid, tha tòrr obrach air a bhith ag amas air modalan cunnairt prognosach a thogail gus mairsinneachd euslaintich aillse a ro-innse agus mar sin dòighean làimhseachaidh atharrachadh [18, 19, 20]. Tha barrachd is barrachd aithne ann air cho cudromach sa tha ceallan dìonachd a’ dol a-steach do cheallan ann an tòiseachadh, adhartas agus freagairt aillse do leigheasan leithid chemotherapy. Tha grunn sgrùdaidhean air dearbhadh gu bheil pàirt chudromach aig ceallan dìonachd a tha a’ dol a-steach do cheallan tumhair ann am freagairt chemotherapy cytotoxic [21, 22, 23]. Tha meanbh-àrainneachd dìonachd an tumhair na fheart cudromach ann am mairsinn euslaintich tumhair [24, 25]. Tha immunotherapy, gu sònraichte leigheas ICI, air a chleachdadh gu farsaing ann an làimhseachadh tumhair chruaidh [26]. Tha ginean co-cheangailte ri dìonachd air an cleachdadh gu farsaing gus modalan cunnairt prognosach a thogail. Mar eisimpleir, Su et al. Tha am modail cunnairt prognosach co-cheangailte ri dìonachd stèidhichte air ginean a tha a’ còdadh pròtain gus ro-innse ro-innse euslaintich aillse ubhagach [27]. Tha ginean neo-chòdaidh leithid lncRNAs cuideachd freagarrach airson modalan cunnairt prognosach a thogail [28, 29, 30]. Rinn Luo et al deuchainn air ceithir lncRNAs co-cheangailte ri dìonachd agus thog iad modail ro-innseach airson cunnart aillse ceirbheacsail [31]. Khan et al. Chaidh 32 tar-sgrìobhaidhean a chomharrachadh gu h-iomlan le diofar sheòrsaichean tar-sgrìobhaidhean, agus stèidhichte air seo, chaidh modail ro-innse le 5 tar-sgrìobhaidhean cudromach a stèidheachadh, a chaidh a mholadh mar inneal a thathar a’ moladh gu mòr airson ro-innse diùltadh géar dearbhte le bith-eòlas às dèidh tar-chur dubhaig [32].
Tha a’ mhòr-chuid de na modailean seo stèidhichte air ìrean abairtean gine, an dàrna cuid ginean a bhios a’ còdadh pròtain no ginean nach eil a’ còdadh. Ach, faodaidh luachan abairtean eadar-dhealaichte a bhith aig an aon ghine ann an diofar genomes, cruthan dàta agus ann an diofar euslaintich, a’ leantainn gu tuairmsean neo-sheasmhach ann am modailean ro-innseach. Anns an sgrùdadh seo, thog sinn modail reusanta le dà phaidhir de lncRNAs, neo-eisimeileach bho na luachan abairtean mionaideach.
Anns an sgrùdadh seo, chomharraich sinn irlncRNA airson a’ chiad uair tro mhion-sgrùdadh co-dhàimh le ginean co-cheangailte ri dìonachd. Rinn sinn sgrìonadh air 223 DEirlncRNA le bhith gan hibridachadh le lncRNA a chaidh a chur an cèill gu eadar-dhealaichte. San dàrna àite, thog sinn maitrís 0-no-1 stèidhichte air an dòigh paidhreachaidh DEirlncRNA a chaidh fhoillseachadh [31]. An uairsin rinn sinn mion-sgrùdaidhean ath-tharraing aon-atharrachail agus lasso gus paidhrichean DEirlncRNA prognosach a chomharrachadh agus modail cunnairt ro-innseach a thogail. Rinn sinn tuilleadh mion-sgrùdadh air a’ cheangal eadar sgòran cunnairt agus feartan clionaigeach ann an euslaintich le PAAD. Fhuair sinn a-mach gun urrainn don mhodail cunnairt prognosach againn, mar fhactar prognosach neo-eisimeileach ann an euslaintich PAAD, eadar-dhealachadh gu h-èifeachdach a dhèanamh eadar euslaintich àrd-ìre agus euslaintich ìosal-ìre agus euslaintich àrd-ìre bho euslaintich ìosal-ìre. A bharrachd air an sin, b’ e luachan AUC lùb ROC a’ mhodail cunnairt prognosach 0.905 airson an ro-aithris 1-bliadhna, 0.942 airson an ro-aithris 2-bhliadhna, agus 0.966 airson an ro-aithris 3-bliadhna.
Dh’innis luchd-rannsachaidh gu robh euslaintich le in-shìoladh cealla T CD8+ nas àirde nas mothachaile air làimhseachadh ICI [33]. Dh’ fhaodadh àrdachadh ann an susbaint cheallan cytotoxic, ceallan NK CD56, ceallan NK agus ceallan T CD8+ ann am meanbh-àrainneachd dìonachd an tumhair a bhith mar aon de na h-adhbharan airson a’ bhuaidh casg-tumhair [34]. Sheall sgrùdaidhean roimhe gu robh ìrean nas àirde de CD4(+) T agus CD8(+) T a’ dol a-steach do tumhair co-cheangailte gu mòr ri mairsinneachd nas fhaide [35]. Bidh droch in-shìoladh cealla T CD8, luchd neoantigen ìosal, agus meanbh-àrainneachd tumhair a tha gu math dìonach a’ leantainn gu dìth freagairt do leigheas ICI [36]. Fhuair sinn a-mach gu robh sgòr cunnairt co-cheangailte gu àicheil ri ceallan T CD8+ agus ceallan NK, a’ nochdadh nach biodh euslaintich le sgòran àrd-chunnart freagarrach airson làimhseachadh ICI agus gu bheil ro-innse nas miosa aca.
’S e comharradh air ceallan marbhtach nàdarrach (NK) a th’ ann an CD161. Bidh ceallan-T air an tar-chur le CAR CD8+CD161+ a’ meadhanachadh èifeachdas an-aghaidh tumhair in vivo nas fheàrr ann am modalan xenograft adenocarcinoma ductal pancreatic HER2+ [37]. Bidh luchd-bacadh puing-sgrùdaidh dìonachd ag amas air slighean pròtain co-cheangailte ri lymphocyte T cytotoxic 4 (CTLA-4) agus pròtain bàis cealla prògramaichte 1 (PD-1)/ligand bàis cealla prògramaichte 1 (PD-L1) agus tha comas mòr aca ann an iomadh raon. Tha abairt CTLA-4 agus CD161 (KLRB1) nas ìsle ann am buidhnean àrd-chunnart, a’ nochdadh a bharrachd nach bi euslaintich le sgòran àrd-chunnart airidh air làimhseachadh ICI. [38]
Gus roghainnean làimhseachaidh a lorg a tha freagarrach do dh’euslaintich àrd-chunnart, rinn sinn mion-sgrùdadh air diofar dhrogaichean an-aghaidh aillse agus fhuair sinn a-mach gum faodadh paclitaxel, sorafenib, agus erlotinib, a thathas a’ cleachdadh gu farsaing ann an euslaintich le PAAD, a bhith freagarrach do dh’euslaintich àrd-chunnart le PAAD. [33]. Fhuair Zhang et al a-mach gum faod mùthaidhean ann an slighe freagairt milleadh DNA (DDR) sam bith leantainn gu droch ro-innse ann an euslaintich aillse prostate [39]. Sheall deuchainn leantainneach aillse pancreatic Olaparib (POLO) gun do leudaich làimhseachadh cumail suas le olaparib mairsinneachd gun adhartas an taca ri placebo às deidh chemotherapy stèidhichte air platanam ciad-loidhne ann an euslaintich le adenocarcinoma ductal pancreatic agus mùthaidhean germline BRCA1 / 2 [40]. Tha seo a’ toirt dòchas mòr gum bi toraidhean làimhseachaidh a’ leasachadh gu mòr san fho-bhuidheann seo de dh’euslaintich. Anns an sgrùdadh seo, bha luach IC50 AZD.2281 (olaparib) nas àirde anns a’ bhuidheann àrd-chunnart, a’ nochdadh gum faodadh euslaintich PAAD anns a’ bhuidheann àrd-chunnart a bhith an aghaidh làimhseachadh le AZD.2281.
Bidh na modailean ro-innse san sgrùdadh seo a’ toirt a-mach deagh thoraidhean ro-innse, ach tha iad stèidhichte air ro-innse anailis. Tha mar a dhearbhas tu na toraidhean seo le dàta clionaigeach na cheist chudromach. Tha ultrasonagrafaidh tarraing snàthaid mhìn endoscopic (EUS-FNA) air a thighinn gu bhith na dhòigh riatanach airson a bhith a’ lorg leòintean pancreatic cruaidh agus extrapancreatic le cugallachd de 85% agus sònrachas de 98% [41]. Tha teachd snàthadan biopsy snàthaid mhìn EUS (EUS-FNB) stèidhichte sa mhòr-chuid air buannachdan a thathas a’ faicinn thairis air FNA, leithid cruinneas breithneachaidh nas àirde, a’ faighinn shamhlaichean a ghleidheas structar histologach, agus mar sin a’ gineadh clò dìonach a tha deatamach airson breithneachaidhean sònraichte. dath sònraichte [42]. Dhearbh ath-sgrùdadh siostamach air an litreachas gu bheil snàthadan FNB (gu sònraichte 22G) a’ nochdadh an èifeachdas as àirde ann a bhith a’ buain clò bho mhais pancreatic [43]. Gu clionaigeach, chan eil ach àireamh bheag de dh’ euslaintich airidh air lannsaireachd radaigeach, agus tha tumhair neo-obrachail aig a’ mhòr-chuid de dh’ euslaintich aig àm a’ chiad bhreithneachaidh. Ann an cleachdadh clionaigeach, chan eil ach cuibhreann beag de dh’ euslaintich freagarrach airson lannsaireachd radaigeach leis gu bheil tumhair neo-obrachail aig a’ mhòr-chuid de dh’ euslaintich aig àm a’ chiad bhreithneachaidh. Às dèidh dearbhadh paiteòlach le EUS-FNB agus dòighean eile, mar as trice thèid làimhseachadh neo-lannsaichte àbhaisteach leithid chemotherapy a thaghadh. Is e ar prògram rannsachaidh às dèidh sin modail prognosach an sgrùdaidh seo a dhearbhadh ann an cohorts lannsaichte agus neo-lannsaichte tro mhion-sgrùdadh ath-shealladh.
Gu h-iomlan, stèidhich an sgrùdadh againn modail cunnairt prognosach ùr stèidhichte air irlncRNA càraideach, a sheall luach prognosach gealltanach ann an euslaintich le aillse pancreatic. Dh’ fhaodadh ar modail cunnairt prognosach cuideachadh le bhith a’ comharrachadh euslaintich le PAAD a tha freagarrach airson làimhseachadh meidigeach.
Tha na seataichean dàta a chaidh a chleachdadh agus a sgrùdadh san sgrùdadh làithreach rim faighinn bhon ùghdar co-fhreagarrach air iarrtas reusanta.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Dreuchd meadhanachaidh fèin-èifeachdais ann an riaghladh faireachail air faireachdainnean àicheil rè galar lèir-sgaoilte COVID-19: sgrùdadh thar-roinneil. Int J Ment Health Nurs [artaigil iris]. 2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J, et al. Beachdan bhuill teaghlaich air co-dhùnaidhean eile ann an aonadan cùram dian: lèirmheas siostamach. INT J NURS STUD [artaigil iris; lèirmheas]. 2023 01/01/2023;137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Aillse pancreatic. Lancet. [Artaigil iris; taic rannsachaidh, NIH, taobh a-muigh na sgìre; taic rannsachaidh, riaghaltas taobh a-muigh nan SA; lèirmheas]. 2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Epidemio-eòlas aillse pancreatic. Iris an t-Saoghail air Gastroenterology. [Artaigil iris, lèirmheas]. 2016 11/28/2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Nomogram ùr co-cheangailte ri tp53 airson ro-innse mairsinn iomlan ann an euslaintich le aillse pancreatic. BMC Cancer [artaigil iris]. 2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Buaidh leigheas stèidhichte air fuasglaidhean air sgìths co-cheangailte ri aillse ann an euslaintich aillse colorectal a tha a’ faighinn chemotherapy: deuchainn fo smachd air thuaiream. Banaltram aillse. [Artaigil iris; deuchainn fo smachd air thuaiream; tha an sgrùdadh air a chumail suas le riaghaltas taobh a-muigh nan Stàitean Aonaichte]. 2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y, et al. Bidh ìrean antigen carcinoembryonic (CEA) às dèidh obair-lannsa a’ ro-innse toradh às dèidh toirt air falbh aillse colorectal ann an euslaintich le ìrean CEA ro-obrachail àbhaisteach. Ionad airson Rannsachadh Aillse Eadar-theangachaidh. [Artaigil iris]. 2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X, et al. Bidh lncRNAs co-cheangailte ris an t-siostam dìon a’ gineadh chomharran ùra agus a’ ro-innse cruth-tìre dìonachd carcinoma hepatocellular daonna. Mol Ther Nucleic acids [Artaigil ann an iris]. 2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Leigheas-dìona airson aillse pancreatic: cnapan-starra agus adhartasan. Ann Gastrointestinal Surgeon [Artaigil iris; lèirmheas]. 2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. RNAs fada neo-chòdaidh (LncRNAs), genomaigs tumhair bhìorasach agus tachartasan spliseadh neo-àbhaisteach: buaidhean leigheasach. AM J CANCER RES [artaigil iris; lèirmheas]. 2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Aithneachadh chomharran lncRNA co-cheangailte ri prognosis aillse endometrial. Coileanaidhean saidheans [artaigil iris]. 2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S, et al. Mion-sgrùdadh coileanta air ginean prognosach pròtain ceangailteach RNA agus tagraichean dhrogaichean ann an carcinoma cealla dubhaig cealla papillary. pregen. [Artaigil iris]. 2021 01/20/2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, et al. Bidh feartan RNA fada neo-chòdaidh co-cheangailte ri autophagy a’ ro-innse prognosis aillse broilleach. pregen. [Artaigil iris]. 2021 01/20/2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Bidh sia soidhnichean lncRNA co-cheangailte ris an t-siostam dìon a’ leasachadh ro-innse ann an glioblastoma multiforme. MOL Neurobiology. [Artaigil iris]. 2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z, et al. Tha soidhne ùr tri-lncRNA a’ ro-innse mairsinn euslaintich le aillse pancreatic. REPRESENTATIVES OF ONKOL. [Artaigil iris]. 2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. Bidh LINC01094 a’ brosnachadh adhartas aillse pancreatic le bhith a’ riaghladh abairt LIN28B agus slighe PI3K/AKT tro miR-577 spongach. Mol Therapeutics – Nucleic acids. 2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, et al. Dh’fhaodadh fios-air-ais dheimhinneach eadar lncRNA FLVCR1-AS1 agus KLF10 bacadh a chur air adhartas aillse pancreatic tron t-slighe PTEN/AKT. J EXP Clin Cancer Res. 2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Comharrachadh trì ginean deug a tha a’ ro-innse mairsinn iomlan ann an carcinoma hepatocellular. Biosci Rep [artaigil iris]. 2021 04/09/2021.
Àm puist: 22 Sultain 2023